Nucleic Acids Research 雑誌表紙デザインサービス（NEMO-TOC）

今すぐ問い合わせる

Nucleic Acids Research
11 July 2022
変換クラスタリングアルゴリズムとポリリボソーム構造プロファイリングにおけるその応用
Wenhong Jiang¹, Jonathan Wagner^2,3, Wenjing Du¹, Juergen Plitzko⁴, Wolfgang Baumeister², Florian Beck⁴ and Qiang Guo^1,5
¹ タンパク質および植物遺伝子研究の国家重点実験室、北京清華生命科学センター、先端学際研究院、北京大学生命科学部、北京100871、中国、
² 構造分子生物学部門、マックス・プランク生化学研究所、Am Klopferspitz 18、82152 Martinsried、ドイツ、
³ 細胞生化学部門、マックス・プランク生化学研究所、Am Klopferspitz 18、82152 Martinsried、ドイツ、
⁴ CryoEM テクノロジー、マックスプランク生化学研究所、Am Klopferspitz 18、82152 Martinsried、ドイツ、
⁵ 昌平研究所、北京、中国
10.1093/nar/gkac547
極低温電子断層撮影のサンプル前処理、電子顕微鏡装置、および画像処理アルゴリズムの改良により、その場での巨大分子の構造解析が進歩しました。個々の高分子のこのような分析を超えて、密集した細胞生息環境における機能的に関連した隣接分子との相互作用の研究、つまり「分子社会学」は生物学において根本的に重要です。ここでは、NEighboring Molecule TOPology Clustering (NEMO-TOC) アルゴリズムを紹介します。私たちは、遺伝子発現において構成的役割と調節的役割の両方を担うポリリボソームの検出とプロファイリング用にこのアルゴリズムを最適化しました。私たちの結果は、ポリソームが複数の非確率的ブロックを接続することによって形成され、翻訳が同期している可能性が高いモデルを示唆しています。